Președinte israelian Shimon Peres l-a primit pe Papa Benedict al XVI-lea la reședința sa din Ierusalim, unde cei doi și-au făcut cadouri, după care au discutat în tete-a-tete. "Am fost foarte emoționați de declarațiile dumneavoastră privind antisemitismul", a declarat Peres în limba engleză, aflat alături de Suveranul Pontif.
Președintele israelian i-a oferit apoi papei Benedict al XVI-lea un Vechi Testament pe care cercetătorii israelieni l-au scris pe un suport electronic din siliciu, de mărimea unei gămălii. Biblia, care este în limba ebraică, a fost gravată pe un suport cu o suprafață de 0,5 milimetri pătrați de către oamenii de știință de la Technion, Institutul Politehnic Israelian.
La rândul său, papa i-a oferit președintelui israelian un tablou cu un candelabru evreiesc auriu. Cei doi au discutat apoi în privat, iar ulterior s-au întâlnit cu familia soldatului israelian Gilad Shalit, deținut de aproape trei ani de către organizația palestiniană Hamas în Fâșia Gaza.
Papa Benedict al XVI-lea a sosit luni în Israel, în cea de-a doua etapă a turneului său în Orientul Mijlociu. La fel ca și în Iordania, nici în Țara Sfântă venirea Sfântului Părinte nu este privită cu ochi buni de toată lumea. Vizita a generat cea mai bizară coaliție împotriva suveranului pontif, formată din homosexuali, militanți de extremă-dreapta și supraviețuitori ai Holocaustului.
Suveranul Pontif și-a făcut deja cunoscută propunerea sa pentru pace în Orientul Mijlociu, chiar din primul moment în care a pus piciorul în Israel. În discursul ținut pe aeroportul din Tel Aviv, Suveranul Pontif a propus buna conviețuire a palestinienilor și evreilor, fiecare în țara lor, dar s-a ferit să folosească explicit formula "două state".
Supreviețuitorii Holocaustului le-au cer automobiliștilor israelieni să claxoneze continuu, în semn de protest, când Papa va rosti un discurs la memorialul Yad Vashem pentru victimele nazismului. Ei îi reproșează suveranului pontif că nu i-a cerut delegatului Vaticanului să părăsească sala unde se desfășura conferința de la Geneva pe tema rasismului în momentul în care președintele iranian Mahmud Ahamadinejad a rostit un discurs antisemit.
Extremiștii de dreapta au manifestat cu banderole pe care scria "Roma este a voastră, iar Ierusalimul al nostru", și au acuzat Biserica Romano-Catolică de jefuirea evreilor de-a lungul istoriei.
La rândul lor, homosexualii îi reproșează Papei intransigența morală care merge până la intoleranță în ceea ce îi privește.