Toader şi-a început mandatul de ministru al Justiţiei în Guvernul Grindeanu, în februarie 2017. În iunie 2017, și-a înaintat demisia din funcție, în semn de solidaritate cu majoritatea membrilor cabinetului. Ulterior, Guvernul Grindeanu a fost demis prin moțiune de cenzură, iar Toader a fost reînvestit în funcția de ministru al Justiției în Cabinetul Tudose.
După ce și Mihai Tudose a fost debarcat din fruntea Executivului, Tudorel Toader și-a păstrat funcția și în Guvernul Dăncilă.
În timpul mandatului său s-au produs modificări importante în justiție, care nu au fost primite deloc bine de majoritatea magistraților.