Costurile s-au modificat după ce în timpul construcţiei au survenit lucrări suplimentare de deviere a conductelor de gaz apă, dar şi a reţelei electrice, care nu au fost planificate iniţial de proiectanţi.
Acum, când podul a ajuns aproape de finalizare, regionala CFR a descoperit că lucrările au loc fără avizele sale şi, mai grav, că nu s-au respectat dimensiunile necesare pentru asigurarea securităţii căilor ferate. Aşa că va fi nevoie de devierea trenurilor pentru a se putea face repoziţionarea stâlpilor. "Proiectul şi execuţia pasajului superior Pipera - Tunari nu au ţinut cont de proiectul de reabilitare a căii ferate. Pasajul rutier trece peste doi stâlpi care au rol de susţinere atât liniei de contact, cât şi a cablului cu fibre optice. În această situaţie, sunt necesare următoarele lucrări: demontarea acestor stâlpi şi repoziţionarea lor, demontarea şi montarea a două semnale de avarie din apropierea staţiei CF Băneasa şi demontarea fibrei optice", potrivit CFR.
Lucrările la pasajul Pipera au început în 2007 şi ar fi trebuit finalizate în noiembrie 2008. Noul termen de finalizare a acestora este august 2009.
