Ministrul Apărării, Teodor Atanasiu, este primul ministru de după 1990, al cărui caz a fost analizat de Comisia specială constituită la Preşedinţie, în baza Legii răspunderii ministerale, în timpul exercitării funcţiei şi care a fost suspendat prin decret prezidenţial.

Toate acestea, ca urmare a două plângeri penale pentru abuz în serviciu, una făcută de consilierul prezidenţial Adriana Săftoiu, cealaltă, de deputatul PSD Eugen Bejinariu.

Plângerea penală depusă de consilierul prezidenţial Adriana Săftoiu se referă la o declaraţie a ministrului Teodor Atanasiu conform căreia el are o întreagă direcţie de informaţii care îi spune ce pleacă de la doamna Săftoiu de la Cotroceni, pe surse credibile din preajma palatului.

Adriana Saftoiu l-a dat în judecată pe Atanasiu pentru abuz în serviciu contra intereselor persoanei. Tot împotriva lui Atanasiu mai există o plângere depusă la Parchet de către deputatul PSD Eugen Bejinariu, care l-a acuzat de abuz în serviciu în chestiunea lobby-ului pe care serviciul secret al Armatei trebuia să-l desfăşoare pe lângă parlamentari.

Comisia specială de la Cotroceni a ajuns la concluzia că Direcţia de Informaţii a Apărării a efectuat acţiunile de lobby la care se referă deputatul PSD Eugen Bejinariu în plângerea sa. Raportul Comisiei speciale mai menţionează că cele două telegrame privind propunerea de retragere a trupelor române din Irak au fost trimise ataşaţilor militari români aflaţi în străinătate în data de 29 iunie 2006, la ordinul ministrului Teodor Atanasiu.

În replică, Atanasiu a susţinut că una dintre cele două telegrame transmise ataşaţilor militari, la care se referă raportul Comisiei speciale de la Cotroceni, a fost trimisă de către şeful Statului Major General, generalul Eugen Bădălan. Potrivit lui Teodor Atanasiu, în telegrama trimisă de Bădălan ataşaţilor militari se preciza că PNL a decis retragrea trupelor române din Irak.