De la înfiinţarea sa şi până în prezent, Consiliul Superior al Magistraturii a trecut prin numeroase scandaluri, cel mai recent referindu-se la acuzaţia de corupţie. Forul a fost criticat şi în două rapoarte ale Comisiei Europene.

La începutul lunii decembrie 2007, DNA anunţa că şase magistraţi au fost puşi sub urmărire penală. Anchetatorii de la anti-corupţie au descoperit că traseul mitei duce pînă în interiorul CSM, către unul dintre membrii Secţiei de procurori al cărui nume nu a fost divulgat. Presa a relatat însă că procurorul Cristian Deliorga a fost audiat de DNA şi că s-a abţinut de la vot atunci cînd s-a discutat reţinerea altor doi procurori din dosarul examenului fraudat.

Printre cei şase magistraţi anchetaţi de DNA se află şi un fost membru al CSM, judecătorul Gheorghe Bucur. Efectele acestui scandal au fost imediate. Procurorul general, Laura Codruţa Kovesi, s-a declarat îngrijorată de situaţia din parchete şi de faptul că procurorii din ţară nu mai vor să se înscrie la examenele de promovare. CSM a avut relaţii tensionate şi cu miniştrii de Justiţie. Consiliul s-a opus încă de la reformelor iniţiate de ministrul Monica Macovei, pe care a acuzat-o că e prea agresivă.

Monica Macovei a criticat la rîndul ei dezinteresul şi absenţa spiritului etic a membrilor CSM. Fostul ministru al Justiţiei a încercat chiar să schimbe componenţa acestui organism denunţând-o pe o fostă colaboratoare a Securităţii, judecatoarea Florica Bejinariu, care a avut parte însă de protecţia colegilor ei.

Nu în ultimul rând, activitatea CSM a fost criticată în două rapoarte succesive ale Comisiei Europene.