Preşedintele CMR, Vasile Astărăstoae, consideră că nu este nevoie de un "tribunal extraordinar" care să judece cazurile de malpraxis şi suţine că acesta nu este constituţional. De asemenea, preşedintele CMR consideră că rolul unei astfel de comisii de judecată ar trebui să fie acela de mediere între pacient şi medic şi de a lua decizii acceptabile pentru ambele părţi.  

În documentul trimis Ministerului Sănătăţii, CMR contestă decizia acestuia de a înfiinţa o Comisie specială de anchetă a cazurilor grave de malpraxis, din moment ce există deja Comisia Superioară de Disciplină.

Colegiul Medicilor atrage atenţia şi asupra faptului că atribuţiile şi competenţele organelor abilitate să gestioneze problema malpraxisului se suprapun. De asemenea, reprezentanţii CMR  afirmă că în proiectul Ministerului Sănătăţii nu sunt precizate clar atribuţiile comisiei de malpraxis de la nivelul autorităţilor de sănătate publică şi nu este recunoscută posibilitatea de împăcare a părţilor şi stingere totală a oricărui litigiu.  CMR mai spune că rolul comisiilor de malpraxis de la nivelul autorităţilor de sănătate publică ar trebui să fie acela de a rezolva doar chestiunile legate de eventualele pretenţii patrimoniale ale pacientului care a fost victima unui caz de malpraxis.

Colegiul Medicilor din România contestă atribuţia Comisiei de malpraxis de a sesiza organele de urmărire penală, deoarece acest lucru i-ar putea expune nejustificat pe membrii comisiei, în situaţia în care, ulterior, o instanţă de judecată ar anula decizia comisiei. CMR mai are nemulţumiri legate de faptul că medicii implicaţi într-un eventual caz de malpraxis nu sunt protejaţi de presiunea pe care mass-media o exercită asupra lor, dar şi asupra comisiilor de judecată.

Ministerul Sănătăţii a iniţiat, la sfărşitul lunii iulie, un proiect de lege pentru modificarea şi completarea legii sănătăţii, privind dispoziţiile care reglementează malpraxisul, proiectul fiind publicat pe site-ul ministerului şi supus dezbaterii publice. În cadrul proiectului, Ministerul Sănătăţii propune înfiinţarea Comisiei speciale de anchetă a cazurilor grave de malpraxis, în cadrul Colegiului Medicilor din România, comisie care analizează şi dispune asupra cazurilor de culpă medicală care au pus în pericol viaţa pacienţilor sau au dus la decesul acestora.